Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATG4DQ86TL0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms