Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TCF23Q7RTU1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF23Q7RTU1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms