Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMIM5Q71RC9 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms