Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 USP3-AS1-204ENST00000559861 620 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LIAT1Q6ZQX7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms