Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
C16orf54Q6UWD8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms