Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
INTS3Q68E01 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
INTS3Q68E01 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms