Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG16L1Q676U5 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG16L1Q676U5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms