Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HES3Q5TGS1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms