Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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COL5A1-AS1Q5SY13 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
COL5A1-AS1Q5SY13 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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COL5A1-AS1Q5SY13 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
COL5A1-AS1Q5SY13 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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