Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BRMS1LQ5PSV4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms