Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM259Q4ZIN3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms