Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MSMPQ1L6U9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms