Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FAM187BQ17R55 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms