Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SYPL1Q16563 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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