Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EXT1Q16394 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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EXT1Q16394 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EXT1Q16394 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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