Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SNCBQ16143 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SNCBQ16143 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SNCBQ16143 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SNCBQ16143 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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