Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SF1Q15637 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SF1Q15637 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SF1Q15637 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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