Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms