Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERPUD1Q15011 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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