Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB39AQ14964 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RAB39AQ14964 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms