Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
BECN1Q14457 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BECN1Q14457 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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