Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSHL1Q14406 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms