Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
COL4A6Q14031 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms