Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDK13Q14004 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK13Q14004 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
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