Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CCINQ13939 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CCINQ13939 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CCINQ13939 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCINQ13939 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCINQ13939 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCINQ13939 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CCINQ13939 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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