Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAPSNQ13702 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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