Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DNASE1L3Q13609 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms