Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAMK2DQ13557 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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