Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
UBE2V1Q13404 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
UBE2V1Q13404 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.39
UBE2V1Q13404 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
UBE2V1Q13404 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms