Protein–RNA interactions for Protein: Q13363

CTBP1, C-terminal-binding protein 1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP1Q13363 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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CTBP1Q13363 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CTBP1Q13363 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CTBP1Q13363 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CTBP1Q13363 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CTBP1Q13363 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CTBP1Q13363 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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CTBP1Q13363 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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CTBP1Q13363 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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CTBP1Q13363 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTBP1Q13363 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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