Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.894e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 MRPS16-205ENST00000479005 2580 ntTSL 216.24■□□□□ 0.194e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 MRPS16-202ENST00000372945 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.044e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 AHNAK-203ENST00000525875 793 ntTSL 312.71□□□□□ -0.374e-7■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 GABARAP-202ENST00000570856 583 ntTSL 215.57■□□□□ 0.083e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 TMEM242-202ENST00000400788 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.72e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 CEP152-210ENST00000561245 577 ntTSL 214.92□□□□□ -0.024e-10■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 CEP152-202ENST00000380950 5635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.764e-10■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PARP12-205ENST00000473341 2861 ntTSL 1 (best)21.58■■□□□ 1.053e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.593e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PARP12-207ENST00000488726 2574 ntTSL 512.37□□□□□ -0.433e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 ATF3-202ENST00000341491 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 ATF3-209ENST00000492118 2103 ntTSL 212.28□□□□□ -0.442e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 ATF3-211ENST00000613954 2031 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.482e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 ATF3-206ENST00000366987 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 SRP68-211ENST00000592704 1941 ntTSL 230.22■■■□□ 2.438e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 KLHL18-202ENST00000433449 560 ntTSL 422.56■■□□□ 1.21e-15■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 KLHL18-203ENST00000437353 463 ntTSL 221.67■■□□□ 1.061e-15■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 KLHL18-206ENST00000483201 375 ntTSL 1 (best)20.57■□□□□ 0.881e-15■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 KLHL18-204ENST00000442272 2249 ntTSL 215.61■□□□□ 0.091e-15■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 KLHL18-205ENST00000461084 3206 ntTSL 212.46□□□□□ -0.411e-15■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 KLHL18-201ENST00000232766 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-15■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.357e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 FKBP2-206ENST00000541388 705 ntTSL 523.21■■□□□ 1.317e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.697e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.327e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 RPS15-204ENST00000586656 436 ntTSL 317.71■□□□□ 0.432e-25■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.773e-34■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.443e-34■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.013e-34■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.133e-34■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.543e-34■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.251e-7■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 11e-7■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.961e-7■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.188e-24■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.922e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.922e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 IFRD2-203ENST00000426499 664 ntTSL 516.43■□□□□ 0.222e-6■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.791e-323■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.611e-323■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 RPLP2-208ENST00000532004 353 ntTSL 318.38■□□□□ 0.531e-323■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 RPL27A-204ENST00000526562 519 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.511e-33■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.381e-11■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PRPF3-202ENST00000467329 2595 ntTSL 510.63□□□□□ -0.711e-11■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PRPF3-204ENST00000470824 898 ntTSL 25.76□□□□□ -1.491e-11■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PSMA4-219ENST00000560217 944 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.175e-11■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.495e-11■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.735e-11■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 C20orf24-207ENST00000494506 874 ntTSL 28.83□□□□□ -16e-7■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 220.04■□□□□ 0.83e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 PDXK-208ENST00000461123 637 ntTSL 319.62■□□□□ 0.733e-8■■■□□ 16.7
PABPC4Q13310 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.43e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 AC120057.3-201ENST00000570760 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.332e-8■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.461e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.934e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ZNF692-208ENST00000470787 1544 ntTSL 225.74■■□□□ 1.714e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ZNF692-203ENST00000412341 1916 ntTSL 525.06■■□□□ 1.64e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ZNF692-211ENST00000477070 1521 ntTSL 524.3■■□□□ 1.484e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.14e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ZNF692-210ENST00000476503 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.67■□□□□ 0.94e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.894e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ZNF692-227ENST00000533927 2026 ntTSL 1 (best)20.02■□□□□ 0.794e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ZNF692-206ENST00000463519 2704 ntTSL 1 (best)15.91■□□□□ 0.144e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ZNF692-213ENST00000482023 851 ntTSL 513.25□□□□□ -0.294e-10■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 EMP3-203ENST00000594198 263 ntTSL 211.83□□□□□ -0.526e-16■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 SRA1-205ENST00000602775 1466 ntTSL 1 (best)18.44■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 SRA1-203ENST00000523259 1802 ntTSL 517.05■□□□□ 0.321e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.081e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 SRA1-206ENST00000602875 769 ntTSL 214.11□□□□□ -0.151e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 SRA1-204ENST00000602657 461 ntTSL 313.31□□□□□ -0.281e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.872e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 DPAGT1-210ENST00000481084 2343 ntTSL 218.27■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 DPAGT1-204ENST00000414373 1638 ntTSL 516.74■□□□□ 0.272e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 DPAGT1-219ENST00000640747 1813 ntTSL 516.37■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 DPAGT1-202ENST00000392834 1817 ntTSL 215.35■□□□□ 0.052e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.022e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 DPAGT1-201ENST00000354202 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 DPAGT1-208ENST00000461999 2125 ntTSL 58.12□□□□□ -1.112e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 DPAGT1-216ENST00000638850 1152 ntTSL 57.44□□□□□ -1.222e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 DPAGT1-215ENST00000636404 700 ntTSL 54.94□□□□□ -1.622e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 519.25■□□□□ 0.673e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-12■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 CCT3-206ENST00000368262 2048 ntTSL 215.1■□□□□ 0.012e-12■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.172e-12■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 CCT3-203ENST00000368258 1885 ntTSL 213.05□□□□□ -0.322e-12■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 CCT3-205ENST00000368261 863 ntTSL 512.36□□□□□ -0.432e-12■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 MFSD10-210ENST00000514031 950 ntTSL 225.18■■□□□ 1.622e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.569e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 MFSD10-203ENST00000503596 1589 ntTSL 523.86■■□□□ 1.412e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.312e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.292e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.252e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.212e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.038e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.012e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 PXN-203ENST00000323871 5457 ntTSL 220.02■□□□□ 0.81e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.578e-7■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 MFSD10-204ENST00000507272 1575 ntTSL 518.5■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 16.6
PABPC4Q13310 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.476e-7■■■□□ 16.6
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