Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RESTQ13127 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RESTQ13127 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RESTQ13127 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RESTQ13127 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RESTQ13127 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RESTQ13127 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RESTQ13127 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RESTQ13127 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RESTQ13127 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RESTQ13127 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RESTQ13127 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RESTQ13127 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RESTQ13127 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RESTQ13127 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RESTQ13127 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RESTQ13127 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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