Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PRDM2Q13029 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRDM2Q13029 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
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