Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
STX4Q12846 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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STX4Q12846 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
STX4Q12846 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
STX4Q12846 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
STX4Q12846 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
STX4Q12846 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
STX4Q12846 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
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