Protein–RNA interactions for Protein: Q08426

EHHADH, Peroxisomal bifunctional enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHHADHQ08426 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EHHADHQ08426 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EHHADHQ08426 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms