Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PSME1Q06323 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms