Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPCQ03188 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms