Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PITX1P78337 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PITX1P78337 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX1P78337 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX1P78337 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX1P78337 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX1P78337 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX1P78337 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX1P78337 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX1P78337 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX1P78337 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PITX1P78337 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms