Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
UBA52P62987 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBA52P62987 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBA52P62987 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBA52P62987 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBA52P62987 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBA52P62987 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBA52P62987 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBA52P62987 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBA52P62987 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
UBA52P62987 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
UBA52P62987 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
UBA52P62987 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms