Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
RPS28P62857 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 HNF1A-201ENST00000257555 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
RPS28P62857 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RPS28P62857 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms