Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
KLF3P57682 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms