Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HIRAP54198 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIRAP54198 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIRAP54198 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIRAP54198 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIRAP54198 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms