Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOSBP53539 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOSBP53539 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOSBP53539 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FOSBP53539 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FOSBP53539 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOSBP53539 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms