Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBX2P52951 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms