Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GRIA1P42261 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms