Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDM5CP41229 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KDM5CP41229 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms