Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FDFT1P37268 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms