Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NUP62P37198 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NUP62P37198 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms