Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RCVRNP35243 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RCVRNP35243 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms