Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LMO2P25791 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LMO2P25791 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
LMO2P25791 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LMO2P25791 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms